El órgano de la iglesia de Santo Domingo es un órgano pequeño, en funcionamiento, que cumple bastante bien las funciones litúrgicas que le son encomendadas.

Instrumento	Órgano de un solo teclado. Instrumento de A.Amezua y Cia.San Sebastián.Guipúzcoa
Disposición	1. Subbajo                   16’ 2. Flauta Armónica      8’ 3. Violón bajos             8’ 4. Violón tiples 8’ 5. Viola de Gamba       8’ 6. Voz Celeste             8’ 7. Octava                    4’ 8. Trompeta Bajos       8’ 9. Trompeta tiples        8’ Trémolo
Otros dispositivos	Acoplamientos: Pedal/manual                       Octavas agudas 1 combinación libre Cuaro botones F.T.A.CL. Pedal de 17 notas ( hasta el mi)